Barghouti, yang kini berusia 66 tahun, merupakan pemimpin senior Fatah. Dia dipandang oleh banyak warga Palestina sebagai calon presiden masa depan. 

Aktivitas politik Barghouti di Fatah yang dipimpin Yasser Arafat dimulai ketika usianya masih anak-anak, yakni 15 tahun. Dia terpilih menjadi anggota Dewan Legislatif Palestina pada 1996.

Barghouti ditangkap pasukan Israel lewat Operasi Perisai Pertahanan pada 2002. Israel menuduhnya mendirikan kelompok militer Brigade Syahid Al-Aqsa. Kelompok itu disebut melakukan serangkaian serangan mematikan terhadap tentara dan pemukim Israel.

Barghouti membantah tudingan Israel, tapi dia tetap dibekuk. Barghouti kemudian dijatuhi lima hukuman penjara seumur hidup ditambah 40 tahun penjara.

Perdana Menteri Israel Benjamin Netanyahu telah secara terbuka menyatakan bahwa "simbol-simbol terorisme, yang dipimpin oleh Barghouti" tidak akan dimasukkan dalam tahap apa pun dari kesepakatan pertukaran tahanan.