Akibat kejadian tersebut, sejumlah KA penumpang terpaksa melalui jalur melingkar. Keseluruhan, ada enam KA penumpang yang dialihkan ke jalur selatan. Antara lain, KA Gajayana relasi Malang-Gambir, KA Argodwipangga relasi Solobalapan-Gambir, KA Bima relasi Malang-Gambir relasi KA Bengawan relasi Purwosari–Pasar senen, KA Jayakarta relasi Surabaya Gubeng-Pasarsenen, dan KA Senja Utama Solo relasi Solobalapan–Pasarsenen.
"Akibat perubahan jalur perjalanan ini, sejumlah KA mengalami keterlambatan perjalanan antara 30 menit hingga 3 jam," kata Hendra.
Selain KA tersebut, sejumlah KA yang berangkat pada Selasa (12/1) juga dibatalkan perjalanannya. Sedangkan KA Ranggajati relasi Cirebon-Jember yang seharusnya melalui stasiun Purwokerto, dialihkan melalui jalur pantura Tegas-Semarang.